interfaz personalizada

Tenemos una solución de software en linux y desde un cliente java la accesamos generando una interfaz limitada por privilegios de un usuario determinado, no contamos con el codigo fuente y el cliente quiere esconder algunos botonos y menus de esta GUI, pensabamos crear algunas cajas para sobreponerlas en las posiciones donde se encuentren estos iconos, seria posible esto.? De tal manera que el cliente no sepa que algun boton o menu debajo de esta caja