Desarrollo aplicación filtrado y procesado de documentos TXT en entorno Windows

Deseo desarrollar una aplicación que debe procesar los archivos TXT de un directorio en base a unos criterios y filtros predefinidos por el usuario de la aplicación. Una vez se hallen coincidencias con los filtros seleccionados esos archivos deben copiarse a otro directorio borrando partes del los mismos.
Uno de los filtros debe desarrollarse con una imagen que con acciones del ratón selecciona distintas regiones de la misma.